La Fundación Jardín Botánico del Quindío es una entidad sin ánimo de lucro, constituida como organización no gubernamental, Están afiliados a Botanic Garden Conservation International (1989), a International Association of Botanic Gardens (1993), a la Red Nacional de Jardines Botánicos (1988) y a la Asociación Latinoamericana y del Caribe de Jardines Botánicos.